体系文件是公司代码和规范的核心部分，是组织和员工了解公司政策和规定的重要渠道。针对体系文件的不当管理，会导致不良后果。因此，管理好公司内部体系文件显得至关重要。
一方面，如果体系文件没有得到恰当的保护，将存在被用户修改，误读，遗失以及泄露等诸多保密隐患。此类事故破坏了公司文化，制度和理念，对组织造成极大伤害。因此，加强对体系文件的保护和管理成为企业必须思考的重要问题。
另一方面，公司内部人员对体系文件的了解和掌握程度也至关重要。没有健全的内部教育和培训机制，员工很难理解和遵守文件中内容和要求。在日常工作中，容易出现不符合要求和标准的行为，破坏了公司的专业形象。因此，加强对体系文件的管理贯穿在人力资源管理各个环节中，包括员工招聘、培训、晋升、奖惩等个个方面。
企业在制定体系文件的时候，必须注重对文件的保护和管理机制的建立。对于公司内部人员，也必须实施不断的培训和教育，让公司内部体系文件成为落实公司精神和理念的纽带。