嘌呤是一种重要的生物分子，在遗传学、农业、医学和药物研究等领域具有普遍的应用价值。嘌呤的一些衍生物还被普遍应用于医药领域，如嘧啶、嘧啶利妥昔单抗等药物。
在人体内，嘌呤是一种重要的核苷酸组成部门，它们在DNA和RNA分子中起到了至关重要的作用。嘌呤还可以通过代谢途径转化为尿酸，当尿酸过量时会引起痛风等疾病。此外，嘌呤还介入了许多重要的代谢路径，如氨基酸代谢、碳水化合物代谢等。
对于植物而言，嘌呤更是不行或缺的营养物质。植物通过嘌呤酸代谢发生了许多重要的生物分子，如细胞壁的多糖和卵白质等。嘌呤还可以被用作肥料，为作物的生长提供足够的氮源。同时，嘌呤仍是植物对外部情形应激的响应分子，能够辅助植物应对干旱、高温等情形压力。